Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms