Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajb11Q99KV1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajb11Q99KV1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajb11Q99KV1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajb11Q99KV1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajb11Q99KV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnajb11Q99KV1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnajb11Q99KV1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnajb11Q99KV1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajb11Q99KV1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms