Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q99KU6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q99KU6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q99KU6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q99KU6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q99KU6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q99KU6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q99KU6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q99KU6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q99KU6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q99KU6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms