Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms