Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms