Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ciao1Q99KN2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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