Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms