Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms