Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms