Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TrabdQ99JY4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TrabdQ99JY4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TrabdQ99JY4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrabdQ99JY4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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TrabdQ99JY4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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TrabdQ99JY4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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TrabdQ99JY4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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TrabdQ99JY4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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