Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms