Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms