Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ctu1Q99J10 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ctu1Q99J10 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ctu1Q99J10 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ctu1Q99J10 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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