Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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