Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripply3Q924S9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms