Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Clip1Q922J3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms