Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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