Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Afg3l1Q920A7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Afg3l1Q920A7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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