Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD4

Vangl2, Vang-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl2Q91ZD4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vangl2Q91ZD4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vangl2Q91ZD4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms