Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm2Q91YD4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm2Q91YD4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms