Protein–RNA interactions for Protein: Q91VY6

Cytip, Cytohesin-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CytipQ91VY6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CytipQ91VY6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CytipQ91VY6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms