Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng5Q8VHW4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms