Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHR5

Gatad2b, Transcriptional repressor p66-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gatad2bQ8VHR5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gatad2bQ8VHR5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gatad2bQ8VHR5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms