Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul7Q8VE73 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul7Q8VE73 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms