Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SnrkQ8VDU5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms