Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms