Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmpQ8R373 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ClmpQ8R373 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms