Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E6

V1ra11, Vomeronasal type-1 receptor A11, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra11Q8R2E6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1ra11Q8R2E6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms