Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Vrk3Q8K3G5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Vrk3Q8K3G5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Vrk3Q8K3G5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Vrk3Q8K3G5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Vrk3Q8K3G5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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