Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms