Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms