Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc12Q8K2L8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms