Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hacd3Q8K2C9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms