Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mtmr3Q8K296 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr3Q8K296 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr3Q8K296 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr3Q8K296 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr3Q8K296 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms