Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacs1Q8K212 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms