Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms