Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sde2Q8K1J5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms