Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms