Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms