Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms