Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgefQ8CHT1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms