Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ep400Q8CHI8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms