Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brf1Q8CFK2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brf1Q8CFK2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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