Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms