Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ufl1Q8CCJ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms