Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb2Q8CC27 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms