Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vwc2Q8C8N3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms