Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms