Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms