Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZG5

Rrnad1, Protein RRNAD1, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrnad1Q8BZG5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rrnad1Q8BZG5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rrnad1Q8BZG5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rrnad1Q8BZG5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rrnad1Q8BZG5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rrnad1Q8BZG5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrnad1Q8BZG5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rrnad1Q8BZG5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rrnad1Q8BZG5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rrnad1Q8BZG5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrnad1Q8BZG5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms